Bom...

1ª- Quando a personagem está assim, significa que foi cegada, e portanto não pode realizar ataques comuns.

2ª- Sobre habilidades secretas, são habilidades passadas pelas gerações para os membros de um determinado clã, o que inclui, mas não se limita a, kekkei genkai. Infelizmente, não tem ulitidade prática no jogo.

3ª- Esta habilidade funciona no mapa. Por exemplo, no mapa "Perto da base de Orochimaru" há um selo na parede, e você só pode quebrá-lo e adentrar na base caso tenha em sua equipe ao menos um ninja com essa habilidade. Aliás, todas as habilidades com fundo marrom são designadas para o mapa.

4ª- Esta "habilidade" não é nada demais. Provavelmente está aí apenas para indicar que Tobi não tem nacionalidade conhecida (e é notavelmente o único que não tem aldeia de origem marcada).

Valeu mano ajudou bastante! :P

O que ele disse está certo, mas só um adendo: as habilidades secretas (kekkei genkkai) tem utilidade no jogo, sim. Por exemplo, a habilidade passiva do Shikamaru dá 100 de defesa e resistência para os ninjas da equipe que tiverem habilidades secretas.