Não sei dizer se é um bug, mas é fato que isso ocorre mesmo. Pra conseguir uma ferramenta amarela na fase do Orochi tem que fazer bastante FG por lá, a ponto de não compensar, pois como você mesmo mencionou, a fase da Akatsuki dá ferramentas amarelas com maior frequência.

Minha sugestão é vocês irem fazendo a fase da Akatsuki mesmo até pegarem 32k de força e liberar a fase dos irmãos uchiha. Esquece a fase do Orochi